شکلگیری مذهب پروتستان در قرن شانزدهم میلادی و ایجاد انشعاب در مسیحیت زمینهساز منازعاتی شد که در تاریخ اروپا به جنگهای مذهبی موسوم میباشد. در 17 ژانویه 1562 میلادی به موجب فرمان صلح نایبالسلطنه شارل نهم، پروتستانها، نوعی آزادی در اعمال مذهبی پیدا کردند. این وضعیت میتوانست به حل منازعات بین این گروه بیانجامد. اما در اول مارس همین سال در جریان عبور رهبر کاتولیکها از منطقه واسی در فرانسه، بین طرفداران دو مذهب درگیری رخ داد که سبب کشته شدن 23 نفر از پروتستانها گردید و جنگهای مذهبی به انتقام از آنها آغاز شد. این جنگها در هشت مرحله حد فاصل سالهای 1562 تا 1598 میلادی جریان داشت.
جنگهای نخستین به نفع پروتستانها به پایان رسید تا اینکه این جنگها پس از 36 سال، در سال 1598 میلادی با فرمان هانری چهارم معروف به فرمان نانْتْ، خاتمه یافت. بر اساس این فرمان یک سری آزادیهایی برای پروتستانها در نظر گرفته شد. از جمله آزادی عقیده، آزادی عبادت خصوصی و دسته جمعی، بهرهمندی از حقوق مدنی، بقای تشکیلات کلیسای پروتستان و... . هفتاد سال بعد از آن، در زمان لویی چهاردهم فرمان نانت ملغی گردید.